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在高离子盐存在的情况下，DNA片断选择性地吸附于离心柱内的硅基质膜上，再通过一系列快速的漂洗－离心的步骤，去蛋白液和漂洗液将引物、核苷酸、蛋白、酶等杂质去除，最后用低盐、高pH值的洗脱缓冲液将纯净DNA从硅基质膜上洗脱。